Снова возвращаемся к карме :). Представим себе ситуацию, причем вполне типичную, когда вы работаете в одном браузере, залогинены там под яндексом, чтобы через webmaster.yandex.ru смотреть, что же там с сайтами происходит.

Под тем же самым логином вы делаете счетчики яндекс метрики и смотрите данные о посещаемости, настраиваете цели, составляете отчеты и тд. ID аккаунта в яндексе тот же.